Do najczęściej stosowanych wymienników w rekuperatorach należą dziś wymienniki krzyżowe. Wymienniki te posiadają prostą konstrukcję, w której nie występują elementy ruchome. Dzięki temu wymiennik nie wymaga dodatkowego zasilania. Wymiennik krzyżowy jest po prostu elementem biernym. Sprawność wymiennika waha się w granicach od 50 do 70 %.
Strumienie powietrza wywiewanego oraz nawiewanego są odseparowane od siebie, a sam przepływ powietrza jest wyjątkowo cichy. W przeciwieństwie do wymiennika obrotowego wymiennik krzyżowy zazwyczaj zatrzymuje wilgoć, przez co w tym rozwiązaniu nie ma możliwości odzysku wilgoci z powietrza wywiewanego. Jednak producenci rekuperatorów oferują wykonania wymienników entalpicznych (pozwalające na odzysk wilgoci) co zostanie opisane w osobnym tekście. Główną wadą omawianego wymiennika, w przypadku braku systemu antyzamrożeniowego, jest możliwość oszronienia co prowadzić może do osłabienia przepływu powietrza i w najgorszym przypadku do całkowitego jego ustania. Aby tego uniknąć w rekuperatorach dobrej klasy, wyposażonych w automatykę sterującą pracą urządzenia, stosowane są nagrzewnice wstępne oraz obejścia ograniczające ilość powietrza przepływającego przez wymiennik.